Os franceses e os britânicos em Java, 1806-15
A queda da Holanda para a França e a dissolução da empresa levaram, no devido tempo, a mudanças significativas na administração das Índias Orientais. Sob Napoleon I a República Batávia tornou-se a Comunidade de Batavia e depois o Reino da Holanda, com um dos marechais de Napoleão, Herman Willem Daendels, servindo como governador-geral. Daendels fortalecido Javanês defesas, levantou novas forças, construiu novas estradas dentro de Java e melhorou a administração interna da ilha. Ele tentou formalizar a posição dos regentes javaneses, subordinando-os aos prefeitos holandeses e enfatizando seu caráter como servidores públicos de um governo central, em vez de governantes locais semi-independentes.
Em 1811 Java caiu para um britânico East India Company força sob o Barão Minto, governador-geral da Índia, que, após a rendição, nomeou Thomas Stamford Raffles vice-governador. Raffles abordou sua tarefa com o convicção que os princípios administrativos britânicos, modelados em parte nos desenvolvidos em Bengala, poderiam libertar os javaneses do tirania dos métodos holandeses; ele acreditava que os princípios econômicos liberais e a cessação do cultivo obrigatório poderiam simultaneamente expandir a produção agrícola javanesa, melhorar a receita e tornar a ilha um mercado para produtos britânicos. Junto com seu liberalismo, Raffles trouxe para sua tarefa o respeito pela sociedade javanesa. Antes de sua nomeação, ele havia sido aluno de malaio literatura e cultura , e durante seu período na Batávia (Jacarta), ele encorajou o estudo da sociedade que encontrou sobre ele. Raffles redescobriu as ruínas do grande templo budista Borobudur no centro de Java e publicou seu História de Java em 1817, um ano após seu retorno à Inglaterra.

Thomas Stamford Raffles, detalhe de uma pintura a óleo de G.F. Joseph, 1817; na National Portrait Gallery, Londres. Cortesia da National Portrait Gallery, Londres
Raffles levou adiante a centralização administrativa iniciada por Daendels e planejou agrupar as regências de Java em 16 residências. Ao declarar todas as terras como propriedade do governo e ao exigir que os agricultores paguem um aluguel pela sua utilização, ele propôs o fim do sistema de produção compulsória. Isso, acreditava ele, libertaria os camponeses do servilismo aos governantes feudais e do fardo das entregas forçadas aos holandeses, permitindo-lhes expandir sua produção sob o estímulo de motivos econômicos comuns. Raffles simplificou demais as complexidades da terra tradicional posse , Contudo. Ele interpretou mal a posição dos regentes, que a princípio ele erroneamente acreditava ser uma classe de proprietários feudais, em vez de um oficial aristocracia . (Os regentes, na verdade, não tinham proprietário direitos sobre a terra de seus súditos.) Mas, apesar de uma série de ajustes em seu plano original, Raffles foi incapaz de conceber um meio eficaz de aplicar suas teorias antes do retorno de Java às mãos dos holandeses como parte do acordo geral após a derrota de Napoleão.
Domínio holandês de 1815 a c. 1920
Antes do século 19, as sociedades indonésias sofreram considerável pressão dos europeus, mas não foram consumidas pelas influências ocidentais. A ordem política de Mataram foi erodida e os primeiros passos foram dados em direção à centralização administrativa em Java. Nas ilhas externas, os governantes locais foram forçados a se submeter, em certa medida, à vontade dos holandeses sediados em Batávia (Jacarta). Os padrões de comércio do arquipélago foram alterados e restringidos. No entanto, estes foram desenvolvimentos superficiais quando vistos contra a continuação coerência e estabilidade das sociedades indonésias. Eles foram superficiais, também, em comparação com o impacto ocidental que ainda está por vir.
Quando os holandeses retornaram à Indonésia em 1815, após o Guerras Napoleônicas , sua principal preocupação era tornar a colônia autossustentável. Durante o interregno, tanto as exportações quanto as receitas diminuíram drasticamente, apesar das esperanças de Raffles para seu sistema de aluguel de terras. Os custos do governo em Java estavam aumentando como resultado da crescente complexidade da administração. Ao restaurar sua autoridade, os holandeses mantiveram os principais contornos do sistema britânico de residências, regências e divisões administrativas inferiores, embora não tenham, a princípio, seguido exatamente as tentativas de Daendels e Raffles de transformar os regentes em funcionários assalariados, especificamente responsável perante os residentes. Em vez disso, eles viam o regente local como o irmão mais novo do residente holandês. Essa diferença teórica teve talvez um leve efeito prático, uma vez que a tendência nos níveis inferiores de administração territorial continuou na direção de um controle cada vez mais centralizado. Vários fatores contribuíram para a tendência: um era a necessidade de lidar com uma série de distúrbios, principalmente em Java e na Sumatra ocidental, mas também em menor escala em Celebes, Bornéu e nas Molucas; a segunda foi a nova política econômica, adotada em 1830, que aumentou as responsabilidades econômicas das autoridades locais.
A Guerra de Java de 1825–30 foi precipitada por várias causas. Em parte, foi o produto das ambições decepcionadas de seu líder, Príncipe Diponegoro , que havia sido preterido para a sucessão ao trono de Yogyakarta. Também era atribuível, no entanto, ao ressentimento crescente entre os proprietários de terras aristocráticos de Yogyakarta, cujos contratos de arrendamento de suas terras aos europeus haviam sido cancelados pelo governador-geral. Houve apoio também dos líderes islâmicos, assim como outros fatores ocultos - como a expectativa da vinda de um governante justo messiânico, que restauraria a harmonia do reino - que sem dúvida aumentaram o clima de descontentamento. Dessa atmosfera agitada irrompeu uma revolta que, por meio do uso habilidoso de táticas de guerrilha, continuou a desafiar a autoridade holandesa por cinco anos, até que os holandeses tomaram Diponegoro durante negociações de trégua e o exilaram em Celebes.
Mais ou menos na mesma época, os holandeses no oeste de Sumatra foram atraídos para a chamada Guerra Padri (batizada em homenagem a Solicitar, uma cidade em Aceh pela qual os peregrinos muçulmanos geralmente voltavam de Meca para casa). Basicamente, a guerra foi uma luta religiosa no país de Minangkabau entre líderes islâmicos revivalistas (chamados de Padris) e os dados (direito consuetudinário) líderes, que eram apoiados pelos holandeses. Sob Tuanku Imam Bonjol, as forças Padri resistiram à pressão holandesa desde o início de 1820 até 1837. Para os holandeses, o efeito desse envolvimento foi inevitavelmente um fortalecimento do compromisso administrativo na Sumatra ocidental.
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